Conectas guia suas ações a partir de planejamentos estratégicos e operacionais – ambos desenvolvidos com ampla participação de toda a equipe. Os objetivos, estratégias e atividades contidos nos planejamentos são definidos com total autonomia e submetidos ao Conselho Deliberativo da organização, que conta com 12 membros, com mandatos de dois anos, e com um Comitê Executivo, formado por 5 pessoas. Os financiadores da organização não participam do planejamento e de sua validação.